Protein–RNA interactions for Protein: O88676

Mmp23, Matrix metalloproteinase-23, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp23O88676 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mmp23O88676 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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