Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnmt3bO88509 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnmt3bO88509 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnmt3bO88509 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnmt3bO88509 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnmt3bO88509 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnmt3bO88509 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnmt3bO88509 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnmt3bO88509 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnmt3bO88509 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnmt3bO88509 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnmt3bO88509 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnmt3bO88509 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnmt3bO88509 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnmt3bO88509 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnmt3bO88509 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnmt3bO88509 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnmt3bO88509 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnmt3bO88509 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnmt3bO88509 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnmt3bO88509 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnmt3bO88509 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnmt3bO88509 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnmt3bO88509 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnmt3bO88509 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnmt3bO88509 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnmt3bO88509 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnmt3bO88509 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnmt3bO88509 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnmt3bO88509 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dnmt3bO88509 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dnmt3bO88509 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dnmt3bO88509 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dnmt3bO88509 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dnmt3bO88509 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dnmt3bO88509 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnmt3bO88509 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms