Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vti1bO88384 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms