Protein–RNA interactions for Protein: O88343

Slc4a4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a4O88343 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc4a4O88343 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms