Protein–RNA interactions for Protein: O70591

Pfdn2, Prefoldin subunit 2, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Pfdn2O70591 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pfdn2O70591 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn2O70591 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pfdn2O70591 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfdn2O70591 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfdn2O70591 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Pfdn2O70591 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn2O70591 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn2O70591 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Pfdn2O70591 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Pfdn2O70591 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn2O70591 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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