Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SfnO70456 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SfnO70456 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SfnO70456 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SfnO70456 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SfnO70456 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SfnO70456 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SfnO70456 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SfnO70456 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SfnO70456 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SfnO70456 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SfnO70456 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SfnO70456 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SfnO70456 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SfnO70456 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SfnO70456 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SfnO70456 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SfnO70456 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SfnO70456 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SfnO70456 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SfnO70456 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SfnO70456 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SfnO70456 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SfnO70456 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SfnO70456 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SfnO70456 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SfnO70456 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SfnO70456 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SfnO70456 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SfnO70456 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SfnO70456 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SfnO70456 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SfnO70456 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SfnO70456 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SfnO70456 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SfnO70456 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SfnO70456 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SfnO70456 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SfnO70456 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SfnO70456 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SfnO70456 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SfnO70456 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SfnO70456 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SfnO70456 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SfnO70456 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SfnO70456 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SfnO70456 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SfnO70456 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SfnO70456 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SfnO70456 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SfnO70456 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SfnO70456 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SfnO70456 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SfnO70456 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SfnO70456 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SfnO70456 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SfnO70456 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SfnO70456 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SfnO70456 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SfnO70456 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SfnO70456 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SfnO70456 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SfnO70456 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SfnO70456 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SfnO70456 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SfnO70456 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SfnO70456 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SfnO70456 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SfnO70456 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SfnO70456 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SfnO70456 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SfnO70456 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SfnO70456 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SfnO70456 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
SfnO70456 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SfnO70456 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SfnO70456 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SfnO70456 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SfnO70456 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SfnO70456 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SfnO70456 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SfnO70456 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SfnO70456 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SfnO70456 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SfnO70456 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SfnO70456 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SfnO70456 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SfnO70456 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SfnO70456 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SfnO70456 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SfnO70456 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SfnO70456 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SfnO70456 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SfnO70456 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SfnO70456 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SfnO70456 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SfnO70456 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SfnO70456 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SfnO70456 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SfnO70456 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms