Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lnx1O70263 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lnx1O70263 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lnx1O70263 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Lnx1O70263 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lnx1O70263 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lnx1O70263 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lnx1O70263 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lnx1O70263 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lnx1O70263 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lnx1O70263 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lnx1O70263 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Lnx1O70263 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lnx1O70263 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lnx1O70263 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lnx1O70263 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lnx1O70263 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lnx1O70263 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lnx1O70263 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lnx1O70263 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lnx1O70263 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms