Protein–RNA interactions for Protein: O70237

Gfi1b, Zinc finger protein Gfi-1b, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1bO70237 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfi1bO70237 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms