Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap1O55125 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Nipsnap1O55125 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms