Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pole2O54956 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pole2O54956 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pole2O54956 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pole2O54956 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pole2O54956 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pole2O54956 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pole2O54956 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pole2O54956 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms