Protein–RNA interactions for Protein: O54824

Il16, Pro-interleukin-16, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il16O54824 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Il16O54824 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Il16O54824 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Il16O54824 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Il16O54824 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Il16O54824 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Il16O54824 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Il16O54824 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Il16O54824 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Il16O54824 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Il16O54824 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Il16O54824 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Il16O54824 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Il16O54824 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Il16O54824 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Il16O54824 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Il16O54824 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Il16O54824 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Il16O54824 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Il16O54824 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Il16O54824 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Il16O54824 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Il16O54824 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Il16O54824 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Il16O54824 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Il16O54824 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Il16O54824 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Il16O54824 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Il16O54824 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Il16O54824 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Il16O54824 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Il16O54824 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Il16O54824 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Il16O54824 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Il16O54824 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Il16O54824 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Il16O54824 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Il16O54824 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Il16O54824 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Il16O54824 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Il16O54824 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Il16O54824 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Il16O54824 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Il16O54824 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Il16O54824 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Il16O54824 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Il16O54824 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Il16O54824 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Il16O54824 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Il16O54824 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Il16O54824 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Il16O54824 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Il16O54824 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Il16O54824 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Il16O54824 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Il16O54824 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Il16O54824 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Il16O54824 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Il16O54824 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Il16O54824 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Il16O54824 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Il16O54824 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Il16O54824 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Il16O54824 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Il16O54824 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Il16O54824 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Il16O54824 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Il16O54824 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Il16O54824 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Il16O54824 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Il16O54824 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Il16O54824 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Il16O54824 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Il16O54824 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Il16O54824 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Il16O54824 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Il16O54824 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Il16O54824 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Il16O54824 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Il16O54824 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Il16O54824 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Il16O54824 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Il16O54824 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Il16O54824 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Il16O54824 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Il16O54824 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Il16O54824 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Il16O54824 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Il16O54824 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Il16O54824 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Il16O54824 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Il16O54824 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Il16O54824 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Il16O54824 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Il16O54824 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Il16O54824 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Il16O54824 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Il16O54824 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Il16O54824 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Il16O54824 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms