Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DffaO54786 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DffaO54786 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DffaO54786 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DffaO54786 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DffaO54786 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DffaO54786 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DffaO54786 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DffaO54786 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DffaO54786 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DffaO54786 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DffaO54786 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DffaO54786 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DffaO54786 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DffaO54786 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DffaO54786 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DffaO54786 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DffaO54786 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DffaO54786 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DffaO54786 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DffaO54786 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DffaO54786 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DffaO54786 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DffaO54786 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DffaO54786 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DffaO54786 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DffaO54786 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DffaO54786 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DffaO54786 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DffaO54786 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DffaO54786 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DffaO54786 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DffaO54786 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DffaO54786 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DffaO54786 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DffaO54786 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DffaO54786 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DffaO54786 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DffaO54786 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DffaO54786 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DffaO54786 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DffaO54786 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DffaO54786 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DffaO54786 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DffaO54786 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DffaO54786 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DffaO54786 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DffaO54786 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DffaO54786 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DffaO54786 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DffaO54786 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DffaO54786 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DffaO54786 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DffaO54786 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DffaO54786 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DffaO54786 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DffaO54786 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DffaO54786 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DffaO54786 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DffaO54786 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DffaO54786 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DffaO54786 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DffaO54786 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DffaO54786 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DffaO54786 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DffaO54786 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DffaO54786 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DffaO54786 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DffaO54786 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DffaO54786 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DffaO54786 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DffaO54786 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DffaO54786 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DffaO54786 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DffaO54786 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DffaO54786 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DffaO54786 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DffaO54786 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DffaO54786 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DffaO54786 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DffaO54786 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DffaO54786 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DffaO54786 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DffaO54786 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DffaO54786 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DffaO54786 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DffaO54786 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DffaO54786 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DffaO54786 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DffaO54786 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DffaO54786 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DffaO54786 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DffaO54786 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DffaO54786 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DffaO54786 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DffaO54786 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DffaO54786 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DffaO54786 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DffaO54786 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DffaO54786 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms