Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccr6O54689 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms