Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab33bO35963 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms