Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccl25O35903 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms