Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Edil3O35474 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Edil3O35474 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Edil3O35474 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edil3O35474 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edil3O35474 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Edil3O35474 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Edil3O35474 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Edil3O35474 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Edil3O35474 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Edil3O35474 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Edil3O35474 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Edil3O35474 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Edil3O35474 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms