Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sema6aO35464 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms