Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
H2-Q1O19441 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-Q1O19441 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-Q1O19441 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-Q1O19441 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-Q1O19441 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-Q1O19441 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-Q1O19441 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-Q1O19441 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-Q1O19441 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-Q1O19441 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-Q1O19441 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-Q1O19441 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-Q1O19441 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-Q1O19441 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-Q1O19441 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-Q1O19441 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-Q1O19441 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-Q1O19441 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-Q1O19441 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-Q1O19441 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-Q1O19441 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms