Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Eftud2O08810 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Eftud2O08810 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms