Protein–RNA interactions for Protein: O08785

Clock, Circadian locomoter output cycles protein kaput, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClockO08785 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClockO08785 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClockO08785 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClockO08785 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClockO08785 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClockO08785 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClockO08785 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClockO08785 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClockO08785 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ClockO08785 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClockO08785 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClockO08785 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClockO08785 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClockO08785 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClockO08785 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClockO08785 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClockO08785 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClockO08785 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClockO08785 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClockO08785 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClockO08785 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClockO08785 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClockO08785 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClockO08785 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClockO08785 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClockO08785 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClockO08785 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ClockO08785 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClockO08785 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClockO08785 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClockO08785 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ClockO08785 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ClockO08785 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClockO08785 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClockO08785 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClockO08785 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClockO08785 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClockO08785 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClockO08785 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClockO08785 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClockO08785 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClockO08785 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClockO08785 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClockO08785 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClockO08785 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClockO08785 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClockO08785 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ClockO08785 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClockO08785 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClockO08785 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClockO08785 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClockO08785 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClockO08785 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClockO08785 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClockO08785 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClockO08785 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClockO08785 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClockO08785 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClockO08785 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClockO08785 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClockO08785 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ClockO08785 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ClockO08785 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ClockO08785 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ClockO08785 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ClockO08785 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ClockO08785 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ClockO08785 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ClockO08785 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ClockO08785 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ClockO08785 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ClockO08785 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClockO08785 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClockO08785 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClockO08785 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClockO08785 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClockO08785 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClockO08785 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClockO08785 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ClockO08785 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClockO08785 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClockO08785 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClockO08785 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClockO08785 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ClockO08785 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ClockO08785 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ClockO08785 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ClockO08785 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ClockO08785 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ClockO08785 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ClockO08785 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ClockO08785 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ClockO08785 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ClockO08785 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ClockO08785 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ClockO08785 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ClockO08785 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ClockO08785 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ClockO08785 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ClockO08785 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms