Protein–RNA interactions for Protein: L7N291

Gm8857, Predicted gene 8857 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8857L7N291 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8857L7N291 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8857L7N291 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8857L7N291 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm8857L7N291 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8857L7N291 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8857L7N291 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8857L7N291 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8857L7N291 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8857L7N291 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms