Protein–RNA interactions for Protein: L7N285

Gm3115, Predicted gene 3115, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3115L7N285 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3115L7N285 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3115L7N285 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3115L7N285 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3115L7N285 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3115L7N285 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3115L7N285 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3115L7N285 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3115L7N285 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3115L7N285 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3115L7N285 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3115L7N285 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3115L7N285 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3115L7N285 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3115L7N285 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3115L7N285 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3115L7N285 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3115L7N285 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3115L7N285 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3115L7N285 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3115L7N285 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3115L7N285 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3115L7N285 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3115L7N285 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3115L7N285 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3115L7N285 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3115L7N285 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3115L7N285 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3115L7N285 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3115L7N285 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3115L7N285 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3115L7N285 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3115L7N285 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3115L7N285 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3115L7N285 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3115L7N285 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3115L7N285 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3115L7N285 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3115L7N285 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3115L7N285 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3115L7N285 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3115L7N285 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3115L7N285 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3115L7N285 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3115L7N285 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3115L7N285 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3115L7N285 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3115L7N285 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3115L7N285 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3115L7N285 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3115L7N285 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3115L7N285 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3115L7N285 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3115L7N285 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3115L7N285 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3115L7N285 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3115L7N285 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3115L7N285 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3115L7N285 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3115L7N285 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3115L7N285 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3115L7N285 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3115L7N285 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3115L7N285 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3115L7N285 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3115L7N285 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3115L7N285 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3115L7N285 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3115L7N285 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3115L7N285 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3115L7N285 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3115L7N285 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3115L7N285 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3115L7N285 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3115L7N285 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3115L7N285 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3115L7N285 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3115L7N285 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3115L7N285 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3115L7N285 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3115L7N285 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3115L7N285 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3115L7N285 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3115L7N285 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3115L7N285 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3115L7N285 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3115L7N285 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3115L7N285 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3115L7N285 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3115L7N285 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3115L7N285 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3115L7N285 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3115L7N285 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3115L7N285 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3115L7N285 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3115L7N285 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3115L7N285 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3115L7N285 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3115L7N285 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3115L7N285 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms