Protein–RNA interactions for Protein: L7N216

Speer4d, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4D, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4dL7N216 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Speer4dL7N216 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Speer4dL7N216 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Speer4dL7N216 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Speer4dL7N216 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Speer4dL7N216 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Speer4dL7N216 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Speer4dL7N216 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Speer4dL7N216 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Speer4dL7N216 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Speer4dL7N216 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Speer4dL7N216 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Speer4dL7N216 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Speer4dL7N216 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Speer4dL7N216 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Speer4dL7N216 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Speer4dL7N216 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Speer4dL7N216 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Speer4dL7N216 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Speer4dL7N216 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Speer4dL7N216 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Speer4dL7N216 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Speer4dL7N216 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Speer4dL7N216 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Speer4dL7N216 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Speer4dL7N216 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Speer4dL7N216 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Speer4dL7N216 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Speer4dL7N216 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Speer4dL7N216 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Speer4dL7N216 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Speer4dL7N216 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Speer4dL7N216 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Speer4dL7N216 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Speer4dL7N216 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer4dL7N216 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer4dL7N216 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer4dL7N216 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer4dL7N216 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer4dL7N216 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer4dL7N216 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms