Protein–RNA interactions for Protein: K9J7G2

Gm8653, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8653K9J7G2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8653K9J7G2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8653K9J7G2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8653K9J7G2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8653K9J7G2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8653K9J7G2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8653K9J7G2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8653K9J7G2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8653K9J7G2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8653K9J7G2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8653K9J7G2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8653K9J7G2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8653K9J7G2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8653K9J7G2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8653K9J7G2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8653K9J7G2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8653K9J7G2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms