Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Gm5849J3QPE5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5849J3QPE5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Gm5849J3QPE5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Gm5849J3QPE5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gm5849J3QPE5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gm5849J3QPE5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gm5849J3QPE5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gm5849J3QPE5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Gm5849J3QPE5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gm5849J3QPE5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5849J3QPE5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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