Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34c2J3QNM1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn34c2J3QNM1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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