Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm6594J3QM43 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm6594J3QM43 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm6594J3QM43 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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