Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20830J3KML6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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