Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pot1bH7BX60 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pot1bH7BX60 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pot1bH7BX60 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pot1bH7BX60 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Pot1bH7BX60 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Pot1bH7BX60 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pot1bH7BX60 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pot1bH7BX60 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pot1bH7BX60 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pot1bH7BX60 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pot1bH7BX60 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pot1bH7BX60 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pot1bH7BX60 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pot1bH7BX60 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Pot1bH7BX60 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pot1bH7BX60 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pot1bH7BX60 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pot1bH7BX60 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pot1bH7BX60 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pot1bH7BX60 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pot1bH7BX60 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pot1bH7BX60 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pot1bH7BX60 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pot1bH7BX60 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pot1bH7BX60 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pot1bH7BX60 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pot1bH7BX60 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pot1bH7BX60 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms