Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm29394H3BIW7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm29394H3BIW7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm29394H3BIW7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm29394H3BIW7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm29394H3BIW7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm29394H3BIW7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm29394H3BIW7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm29394H3BIW7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm29394H3BIW7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms