Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp17lcG5E8I7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp17lcG5E8I7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms