Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp9yF8VPU6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp9yF8VPU6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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