Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK0

Ttc37, Tetratricopeptide repeat domain 37, mousemouse

Predictions only

Length 1,563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc37F8VPK0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ttc37F8VPK0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ttc37F8VPK0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ttc37F8VPK0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ttc37F8VPK0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ttc37F8VPK0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ttc37F8VPK0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ttc37F8VPK0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ttc37F8VPK0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ttc37F8VPK0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ttc37F8VPK0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ttc37F8VPK0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ttc37F8VPK0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Ttc37F8VPK0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ttc37F8VPK0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ttc37F8VPK0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Ttc37F8VPK0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Ttc37F8VPK0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ttc37F8VPK0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Ttc37F8VPK0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ttc37F8VPK0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ttc37F8VPK0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ttc37F8VPK0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ttc37F8VPK0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ttc37F8VPK0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ttc37F8VPK0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ttc37F8VPK0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ttc37F8VPK0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ttc37F8VPK0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ttc37F8VPK0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ttc37F8VPK0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ttc37F8VPK0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Ttc37F8VPK0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ttc37F8VPK0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ttc37F8VPK0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ttc37F8VPK0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ttc37F8VPK0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Ttc37F8VPK0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ttc37F8VPK0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ttc37F8VPK0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ttc37F8VPK0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ttc37F8VPK0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ttc37F8VPK0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ttc37F8VPK0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ttc37F8VPK0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ttc37F8VPK0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ttc37F8VPK0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ttc37F8VPK0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ttc37F8VPK0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ttc37F8VPK0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Ttc37F8VPK0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
Ttc37F8VPK0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ttc37F8VPK0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ttc37F8VPK0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ttc37F8VPK0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ttc37F8VPK0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ttc37F8VPK0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Ttc37F8VPK0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ttc37F8VPK0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ttc37F8VPK0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ttc37F8VPK0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ttc37F8VPK0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ttc37F8VPK0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ttc37F8VPK0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ttc37F8VPK0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ttc37F8VPK0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Ttc37F8VPK0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ttc37F8VPK0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ttc37F8VPK0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ttc37F8VPK0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ttc37F8VPK0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ttc37F8VPK0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ttc37F8VPK0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ttc37F8VPK0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ttc37F8VPK0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ttc37F8VPK0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ttc37F8VPK0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ttc37F8VPK0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ttc37F8VPK0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ttc37F8VPK0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ttc37F8VPK0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ttc37F8VPK0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ttc37F8VPK0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ttc37F8VPK0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Ttc37F8VPK0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ttc37F8VPK0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ttc37F8VPK0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ttc37F8VPK0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ttc37F8VPK0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ttc37F8VPK0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ttc37F8VPK0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ttc37F8VPK0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ttc37F8VPK0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ttc37F8VPK0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ttc37F8VPK0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ttc37F8VPK0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ttc37F8VPK0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ttc37F8VPK0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ttc37F8VPK0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ttc37F8VPK0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms