Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm20538F6Z9R1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm20538F6Z9R1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms