Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8005F6YKY3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm8005F6YKY3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm8005F6YKY3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm8005F6YKY3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm8005F6YKY3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm8005F6YKY3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm8005F6YKY3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8005F6YKY3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8005F6YKY3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8005F6YKY3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8005F6YKY3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8005F6YKY3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8005F6YKY3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8005F6YKY3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8005F6YKY3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8005F6YKY3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8005F6YKY3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8005F6YKY3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8005F6YKY3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8005F6YKY3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8005F6YKY3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8005F6YKY3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8005F6YKY3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8005F6YKY3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8005F6YKY3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8005F6YKY3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8005F6YKY3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8005F6YKY3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8005F6YKY3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8005F6YKY3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8005F6YKY3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8005F6YKY3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8005F6YKY3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8005F6YKY3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8005F6YKY3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8005F6YKY3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8005F6YKY3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8005F6YKY3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8005F6YKY3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8005F6YKY3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8005F6YKY3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8005F6YKY3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms