Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Igkv1-99F6XWB2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Igkv1-99F6XWB2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Igkv1-99F6XWB2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Igkv1-99F6XWB2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Igkv1-99F6XWB2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Igkv1-99F6XWB2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Igkv1-99F6XWB2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Igkv1-99F6XWB2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Igkv1-99F6XWB2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Igkv1-99F6XWB2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Igkv1-99F6XWB2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Igkv1-99F6XWB2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Igkv1-99F6XWB2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Igkv1-99F6XWB2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Igkv1-99F6XWB2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Igkv1-99F6XWB2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Igkv1-99F6XWB2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Igkv1-99F6XWB2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Igkv1-99F6XWB2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Igkv1-99F6XWB2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Igkv1-99F6XWB2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Igkv1-99F6XWB2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Igkv1-99F6XWB2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Igkv1-99F6XWB2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Igkv1-99F6XWB2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Igkv1-99F6XWB2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Igkv1-99F6XWB2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Igkv1-99F6XWB2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Igkv1-99F6XWB2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Igkv1-99F6XWB2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Igkv1-99F6XWB2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Igkv1-99F6XWB2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Igkv1-99F6XWB2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Igkv1-99F6XWB2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Igkv1-99F6XWB2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Igkv1-99F6XWB2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Igkv1-99F6XWB2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Igkv1-99F6XWB2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Igkv1-99F6XWB2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Igkv1-99F6XWB2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Igkv1-99F6XWB2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Igkv1-99F6XWB2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms