Protein–RNA interactions for Protein: F6SKY8

Gm3072, Predicted gene 3072 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3072F6SKY8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3072F6SKY8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3072F6SKY8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3072F6SKY8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3072F6SKY8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3072F6SKY8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3072F6SKY8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3072F6SKY8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3072F6SKY8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3072F6SKY8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3072F6SKY8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3072F6SKY8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3072F6SKY8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3072F6SKY8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3072F6SKY8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3072F6SKY8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3072F6SKY8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3072F6SKY8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3072F6SKY8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3072F6SKY8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3072F6SKY8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3072F6SKY8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3072F6SKY8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3072F6SKY8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3072F6SKY8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3072F6SKY8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3072F6SKY8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3072F6SKY8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3072F6SKY8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3072F6SKY8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3072F6SKY8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3072F6SKY8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3072F6SKY8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3072F6SKY8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3072F6SKY8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3072F6SKY8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3072F6SKY8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3072F6SKY8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3072F6SKY8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3072F6SKY8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3072F6SKY8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3072F6SKY8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3072F6SKY8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3072F6SKY8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3072F6SKY8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3072F6SKY8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3072F6SKY8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3072F6SKY8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3072F6SKY8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3072F6SKY8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3072F6SKY8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3072F6SKY8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms