Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Herc6F2Z461 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Herc6F2Z461 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Herc6F2Z461 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Herc6F2Z461 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Herc6F2Z461 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Herc6F2Z461 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Herc6F2Z461 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Herc6F2Z461 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Herc6F2Z461 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Herc6F2Z461 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Herc6F2Z461 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Herc6F2Z461 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Herc6F2Z461 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Herc6F2Z461 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Herc6F2Z461 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Herc6F2Z461 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Herc6F2Z461 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Herc6F2Z461 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Herc6F2Z461 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Herc6F2Z461 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Herc6F2Z461 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Herc6F2Z461 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Herc6F2Z461 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Herc6F2Z461 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Herc6F2Z461 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Herc6F2Z461 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Herc6F2Z461 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Herc6F2Z461 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Herc6F2Z461 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Herc6F2Z461 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Herc6F2Z461 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Herc6F2Z461 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Herc6F2Z461 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Herc6F2Z461 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Herc6F2Z461 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms