Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lmod3E9QA62 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmod3E9QA62 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmod3E9QA62 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmod3E9QA62 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmod3E9QA62 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmod3E9QA62 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmod3E9QA62 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmod3E9QA62 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmod3E9QA62 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmod3E9QA62 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmod3E9QA62 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmod3E9QA62 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmod3E9QA62 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmod3E9QA62 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmod3E9QA62 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmod3E9QA62 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmod3E9QA62 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmod3E9QA62 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmod3E9QA62 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmod3E9QA62 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmod3E9QA62 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmod3E9QA62 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmod3E9QA62 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms