Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc7bE9Q9Y3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc7bE9Q9Y3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms