Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8Q6

Ccdc141, Coiled-coil domain-containing 141, mousemouse

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc141E9Q8Q6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccdc141E9Q8Q6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccdc141E9Q8Q6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccdc141E9Q8Q6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccdc141E9Q8Q6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccdc141E9Q8Q6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccdc141E9Q8Q6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccdc141E9Q8Q6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc141E9Q8Q6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc141E9Q8Q6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc141E9Q8Q6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc141E9Q8Q6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc141E9Q8Q6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc141E9Q8Q6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc141E9Q8Q6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ccdc141E9Q8Q6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ccdc141E9Q8Q6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ccdc141E9Q8Q6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ccdc141E9Q8Q6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc141E9Q8Q6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc141E9Q8Q6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc141E9Q8Q6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc141E9Q8Q6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc141E9Q8Q6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc141E9Q8Q6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc141E9Q8Q6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc141E9Q8Q6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc141E9Q8Q6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc141E9Q8Q6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc141E9Q8Q6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc141E9Q8Q6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc141E9Q8Q6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc141E9Q8Q6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc141E9Q8Q6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc141E9Q8Q6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc141E9Q8Q6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc141E9Q8Q6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc141E9Q8Q6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc141E9Q8Q6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc141E9Q8Q6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc141E9Q8Q6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc141E9Q8Q6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc141E9Q8Q6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc141E9Q8Q6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc141E9Q8Q6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc141E9Q8Q6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc141E9Q8Q6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc141E9Q8Q6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc141E9Q8Q6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc141E9Q8Q6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc141E9Q8Q6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc141E9Q8Q6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc141E9Q8Q6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc141E9Q8Q6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc141E9Q8Q6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc141E9Q8Q6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc141E9Q8Q6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc141E9Q8Q6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc141E9Q8Q6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc141E9Q8Q6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc141E9Q8Q6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc141E9Q8Q6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc141E9Q8Q6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc141E9Q8Q6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc141E9Q8Q6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc141E9Q8Q6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc141E9Q8Q6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc141E9Q8Q6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc141E9Q8Q6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc141E9Q8Q6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc141E9Q8Q6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc141E9Q8Q6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc141E9Q8Q6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc141E9Q8Q6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc141E9Q8Q6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc141E9Q8Q6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc141E9Q8Q6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc141E9Q8Q6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc141E9Q8Q6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc141E9Q8Q6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc141E9Q8Q6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc141E9Q8Q6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc141E9Q8Q6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc141E9Q8Q6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc141E9Q8Q6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc141E9Q8Q6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc141E9Q8Q6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc141E9Q8Q6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc141E9Q8Q6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc141E9Q8Q6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc141E9Q8Q6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc141E9Q8Q6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc141E9Q8Q6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc141E9Q8Q6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc141E9Q8Q6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc141E9Q8Q6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc141E9Q8Q6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc141E9Q8Q6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc141E9Q8Q6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc141E9Q8Q6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms