Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Urb2E9Q7L1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Urb2E9Q7L1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Urb2E9Q7L1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Urb2E9Q7L1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
Urb2E9Q7L1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Urb2E9Q7L1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Urb2E9Q7L1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Urb2E9Q7L1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Urb2E9Q7L1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Urb2E9Q7L1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Urb2E9Q7L1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Urb2E9Q7L1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
Urb2E9Q7L1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
Urb2E9Q7L1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Urb2E9Q7L1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Urb2E9Q7L1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Urb2E9Q7L1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Urb2E9Q7L1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Urb2E9Q7L1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Urb2E9Q7L1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Urb2E9Q7L1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Urb2E9Q7L1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Urb2E9Q7L1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Urb2E9Q7L1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Urb2E9Q7L1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Urb2E9Q7L1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
Urb2E9Q7L1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
Urb2E9Q7L1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Urb2E9Q7L1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Urb2E9Q7L1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Urb2E9Q7L1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Urb2E9Q7L1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Urb2E9Q7L1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Urb2E9Q7L1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Urb2E9Q7L1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
Urb2E9Q7L1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Urb2E9Q7L1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Urb2E9Q7L1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Urb2E9Q7L1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Urb2E9Q7L1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Urb2E9Q7L1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Urb2E9Q7L1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Urb2E9Q7L1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Urb2E9Q7L1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Urb2E9Q7L1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Urb2E9Q7L1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Urb2E9Q7L1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Urb2E9Q7L1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Urb2E9Q7L1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Urb2E9Q7L1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Urb2E9Q7L1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Urb2E9Q7L1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Urb2E9Q7L1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Urb2E9Q7L1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Urb2E9Q7L1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Urb2E9Q7L1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Urb2E9Q7L1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Urb2E9Q7L1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Urb2E9Q7L1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Urb2E9Q7L1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Urb2E9Q7L1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Urb2E9Q7L1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Urb2E9Q7L1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Urb2E9Q7L1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Urb2E9Q7L1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Urb2E9Q7L1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Urb2E9Q7L1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Urb2E9Q7L1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
Urb2E9Q7L1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Urb2E9Q7L1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Urb2E9Q7L1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Urb2E9Q7L1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Urb2E9Q7L1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Urb2E9Q7L1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Urb2E9Q7L1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Urb2E9Q7L1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Urb2E9Q7L1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Urb2E9Q7L1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.61
Urb2E9Q7L1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC31.39■■■□□ 2.61
Urb2E9Q7L1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
Urb2E9Q7L1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
Urb2E9Q7L1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Urb2E9Q7L1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Urb2E9Q7L1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Urb2E9Q7L1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
Urb2E9Q7L1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Urb2E9Q7L1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Urb2E9Q7L1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Urb2E9Q7L1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Urb2E9Q7L1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Urb2E9Q7L1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Urb2E9Q7L1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Urb2E9Q7L1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Urb2E9Q7L1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Urb2E9Q7L1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Urb2E9Q7L1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Urb2E9Q7L1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Urb2E9Q7L1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Urb2E9Q7L1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms