Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R1

Itga10, Integrin, alpha 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga10E9Q6R1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga10E9Q6R1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Itga10E9Q6R1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga10E9Q6R1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga10E9Q6R1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga10E9Q6R1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga10E9Q6R1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga10E9Q6R1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga10E9Q6R1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga10E9Q6R1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga10E9Q6R1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga10E9Q6R1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga10E9Q6R1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga10E9Q6R1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga10E9Q6R1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga10E9Q6R1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga10E9Q6R1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga10E9Q6R1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga10E9Q6R1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga10E9Q6R1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga10E9Q6R1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga10E9Q6R1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga10E9Q6R1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga10E9Q6R1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga10E9Q6R1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga10E9Q6R1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga10E9Q6R1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga10E9Q6R1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga10E9Q6R1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga10E9Q6R1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga10E9Q6R1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga10E9Q6R1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga10E9Q6R1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga10E9Q6R1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga10E9Q6R1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga10E9Q6R1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga10E9Q6R1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga10E9Q6R1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga10E9Q6R1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga10E9Q6R1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga10E9Q6R1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga10E9Q6R1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga10E9Q6R1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga10E9Q6R1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga10E9Q6R1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms