Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srsf11E9Q6E5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srsf11E9Q6E5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srsf11E9Q6E5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Srsf11E9Q6E5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Srsf11E9Q6E5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Srsf11E9Q6E5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Srsf11E9Q6E5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Srsf11E9Q6E5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Srsf11E9Q6E5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Srsf11E9Q6E5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Srsf11E9Q6E5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Srsf11E9Q6E5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Srsf11E9Q6E5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Srsf11E9Q6E5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms