Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm20518E9Q548 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20518E9Q548 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms