Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trip11E9Q512 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trip11E9Q512 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trip11E9Q512 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trip11E9Q512 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trip11E9Q512 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trip11E9Q512 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trip11E9Q512 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trip11E9Q512 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trip11E9Q512 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trip11E9Q512 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trip11E9Q512 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trip11E9Q512 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trip11E9Q512 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trip11E9Q512 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trip11E9Q512 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trip11E9Q512 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trip11E9Q512 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trip11E9Q512 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trip11E9Q512 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trip11E9Q512 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Trip11E9Q512 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trip11E9Q512 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trip11E9Q512 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trip11E9Q512 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trip11E9Q512 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trip11E9Q512 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Trip11E9Q512 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms