Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc71lE9Q4T4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms