Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4N7

Arid1b, AT-rich interactive domain-containing protein 1B, mousemouse

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Length 2,244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid1bE9Q4N7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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Arid1bE9Q4N7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arid1bE9Q4N7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arid1bE9Q4N7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arid1bE9Q4N7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Arid1bE9Q4N7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arid1bE9Q4N7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arid1bE9Q4N7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arid1bE9Q4N7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arid1bE9Q4N7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arid1bE9Q4N7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arid1bE9Q4N7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arid1bE9Q4N7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Arid1bE9Q4N7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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Arid1bE9Q4N7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Arid1bE9Q4N7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Arid1bE9Q4N7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Arid1bE9Q4N7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Arid1bE9Q4N7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arid1bE9Q4N7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arid1bE9Q4N7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Arid1bE9Q4N7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arid1bE9Q4N7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arid1bE9Q4N7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arid1bE9Q4N7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arid1bE9Q4N7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arid1bE9Q4N7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arid1bE9Q4N7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arid1bE9Q4N7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arid1bE9Q4N7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Arid1bE9Q4N7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.8 ms