Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3J7

Gm3020, Predicted gene 3020, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3020E9Q3J7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm3020E9Q3J7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm3020E9Q3J7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm3020E9Q3J7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm3020E9Q3J7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm3020E9Q3J7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm3020E9Q3J7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm3020E9Q3J7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm3020E9Q3J7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm3020E9Q3J7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm3020E9Q3J7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3020E9Q3J7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3020E9Q3J7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3020E9Q3J7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3020E9Q3J7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3020E9Q3J7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3020E9Q3J7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3020E9Q3J7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3020E9Q3J7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3020E9Q3J7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3020E9Q3J7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3020E9Q3J7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3020E9Q3J7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3020E9Q3J7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3020E9Q3J7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3020E9Q3J7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms