Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Susd1E9Q3H4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Susd1E9Q3H4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms